Središnji lik u "A Most Wanted Man" je Issa, mladi Čečen i predani musliman koji dolazi u Hamburg i izaziva sumnjičavost u njemačkoj špijunskoj zajednici zbog moguće povezanosti s islamskim militantima.
Njemačka odvjetnica za ljudska prava Annabel pokušava ga spasiti od deportiranja i pomoći mu da naslijedi novac koji mu je otac ostavio na tajnom računu koji kontrolira 60-godišnji britanski bankar Tommy Brue.
Suparničke obavještajne službe Njemačke, V. Britanije i SAD-a imaju vlastite teorije o tome tko je Issa i njegovi suradnici i na kraju odluče o njihovoj sudbini.