Šaman nas vodi u devetnaesto stoljeće gdje upoznajemo doktora Roberta Judsona Colea koji iz rodne Škotske bježi u Novi svijet, gdje kao liječnik najprije radi u Bostonu, a potom se kod indijanskoga plemena Sauka upoznaje s iscjeliteljskim moćima prirode. Ujedno pratimo i životni put njegova sina Roberta Jeffersona Colea – Šamana, i cijele obitelji upletene, zajedno s čitavom Amerikom, u sukob između Sjevera i Juga.